В 1998 году в Российской Федерации принят Федеральный закон «О борьбе с терроризмом», который впервые установил правовые и организационные основы борьбы с терроризмом, порядок взаимодействия и координации органов власти в борьбе с терроризмом.

1 сентября 2004 года, несмотря на принимаемые меры, в г. Беслан совершён террористический акт, погибли 334 человека, в том числе 186 детей. Руководством страны принято решение об изменении законодательства и разработке новой общегосударственной системы, закрепляющей права и обязанности правоохранительных органов, специальных служб, органов исполнительной власти по участию в антитеррористической деятельности на территории каждого субъекта Российской Федерации.

Введены в действие:

- Указ Президента Российской Федерации «О мерах по противодействию терроризму» от 15 февраля 2006 года № 116;

- Федеральный закон «О противодействии терроризму» от 6 марта 2006 года № 35-ФЗ.

В соответствии с Указом и Федеральным законом в Российской Федерации созданы координационные межведомственные структуры:

- Национальный антитеррористический комитет (НАК);

- Федеральный оперативный штаб (ФОШ).

Председателем НАК и руководителем ФОШ по должности является Директор ФСБ России.

В субъектах Российской Федерации образованы:

- антитеррористические комиссии (АТК);

5 октября 2009 года Президентом России утверждена Концепция противодействия терроризму в Российской Федерации.